Feidhmíonn struchtúr idirmheánacha cógaisíochta mar dhroichead a nascann amhábhair cheimiceacha bunúsacha agus na móilíní spriocdhrugaí. Cinneann réasúntacht a ndearadh go díreach féidearthacht an bhealaigh shintéiseach agus cáilíocht an druga deiridh. Sa cheimic íocshláinte, ní hamháin go n-iompraíonn an struchtúr idirmheánach sainghrúpaí feidhmiúla agus suíomhanna imoibrithe ach tá faisnéis steiré-cheimiceach agus bunghnéithe na gcaidreamh gníomhaíochta struchtúir, á mheas mar ghné lárnach de straitéisí sintéiseacha.
Ó thaobh comhdhéanamh ceimiceach de, is gnách go mbíonn idirmheánacha cógaisíochta comhdhéanta de chnámharlach carbóin in éineacht le grúpaí feidhme éagsúla. Cinneann an cnámharlach carbóin cruth bunúsach agus cumas spásúil an mhóilín, agus soláthraíonn grúpaí feidhmiúla cosúil le bannaí hiodrocsaile, aimín, carboxyl, halaigine, agus amide na suíomhanna gníomhacha agus an bunús le haghaidh rialú roghnach in imoibrithe ina dhiaidh sin. Is minic a dhéantar ionaid chiriúla, atá coitianta i móilíní casta drugaí, a fhoirmiú go luath-idirmheánacha. Ní mór a n-steirióchumraíocht a rialú go docht trí shintéis neamhshiméadrach nó ionduchtú ciriúil; ar shlí eile, féadfar enantiomers neamhéifeachtacha nó díobhálacha a ghiniúint i gclaochluithe ina dhiaidh sin, rud a chuirfeadh isteach ar ghníomhaíocht cógaseolaíochta agus ar shábháilteacht.
Léiríonn an struchtúr tréith deighilte, forásach freisin. Is minic a bhriseann bealaí sintéiseacha an sprioc-mhóilín i roinnt blúirí struchtúracha, agus is céim idirmheánach é táirge sintéiseach gach blúire. Bhí struchtúir luatha idirmheánacha sách simplí, ag díriú ar chreat-thógáil agus ar thabhairt isteach na bpríomhghrúpaí feidhme. De réir mar a chuaigh an tsintéis ar aghaidh, d'éirigh struchtúir idirmheánacha níos casta de réir a chéile, ag taispeáint tréithe cosúil le córais il-thimthriallacha, intercalation heteroatom, agus bac steiriúil méadaithe. Ceadaíonn an dul chun cinn ordlathach seo ó shimplí go coimpléasc íonú agus rialú cáilíochta ag gach céim den phróiseas sintéise, rud a laghdóidh an baol carnadh eisíontais.
Caithfidh dearadh struchtúrach féidearthacht an fhrithghníomhaithe agus stóinseacht an phróisis a chur san áireamh freisin. D’fhéadfadh roinnt grúpaí feidhme a bheith éagobhsaí nó íogair do dhálaí imoibrithe sna céimeanna ina dhiaidh sin, a éilíonn cosaint nó claochlú ag an gcéim idirmheánach; is féidir le daoine eile gníomhú mar ghrúpaí a stiúradh nó a ghníomhachtú, ag feabhsú regio agus steiré-roghnaíocht. Ina theannta sin, bíonn tionchar ag polaraíocht, tuaslagthacht agus criostalacht an struchtúir ar éifeachtúlacht scaradh agus íonú, agus ní mór iad a chothromú le linn na tógála móilíneach.
Le cur chun cinn na ceimice glas agus teicneolaíochtaí sreabhadh leanúnach, tá struchtúir idirmheánacha ag éirí níos treochta i dtreo dearaí atá íseal i tocsaineacht, atá in-athchúrsáilte go héasca, agus inoiriúnaithe do choinníollacha éadroma, ag laghdú ualach comhshaoil tuaslagóirí agus seachtháirgí.
Tríd is tríd, is iad struchtúir idirmheánacha cógaisíochta an chuimsiú fisiciceimiceach de loighic sintéise ceimiceach, ag comhtháthú gnéithe iomadúla de struchtúr móilíneach, steirérialú, agus inoiriúnaitheacht próisis, agus is bunchloch iad de tháirgeadh cógaisíochta atá éifeachtach, sábháilte agus inbhuanaithe.